Author Archives: Fabrice Monna

L’article ‘Machine learning for rapid mapping of archaeological structures made of dry stones – Example of burial monuments from the Khirgisuur culture, Mongolia –’ vient d’être publié dans Journal of Cultural Heritage

Les images produites à partir de l’orthomosaïque et du DEM alimentant l’algorithme d’intelligence artificielle

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L’article “Machine learning for rapid mapping of archaeological structures made of dry stones – Example of burial monuments from the Khirgisuur culture, Mongolia –” par  Monna, F.; Magail, J.; Rolland, T.; Navarro, N.; Wilczek, J.; Gantulga, J.O.; Esin, Y.; Granjon, L.; Allard, A.-C. Chateau-Smith, C.  vient d’être publié dans Journal of Cultural Heritage. 43, 118-128.

La présente étude, menée dans le cadre du projet ROSAS, propose un workflow pour extraire des orthomosaïques l’énorme quantité de pierres sèches utilisées pour construire les complexes funéraires des steppes mongoles. Plusieurs algorithmes d’apprentissage automatique pour la classification binaire des pixels (c.-à-d. Pierres vs Non pierres) ont été évalués. Les données utilisées en entrée ont été extraites d’orthomosaïques haute résolution et de modèles numériques d’élévation (tous deux dérivés de l’imagerie aérienne par drone). L’analyse comparative a utilisé deux espaces colorimétriques (RVB et HSV), des caractéristiques de texture (cartes matricielles de contraste, d’homogénéité et d’entropie) et l’indice de position topographique, combinés à neuf algorithmes d’apprentissage supervisé (centroïde le plus proche, Bayes naïfs, k voisins les plus proches, régression logistique , analyses discriminantes linéaires et quadratiques, machine à vecteurs de support, forêt aléatoire et réseau neuronal artificiel). Lorsque les entités sont traitées ensemble, d’excellentes cartes de sortie, très proches ou surpassant les normes actuelles en archéologie, sont observées pour presque tous les modèles.

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L’article ‘La collection historique d’échantillons de sols de l’essai patrimonial des ‘42 parcelles’ (INRAE, Versailles) : une machine à remonter le temps… Etude et Gestion des Sols’ par van Oort et al. vient d’être publié dans Etude et Gestion des Sols.

La collection de sols de près de 100 ans possédée par l’INRAE

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L’article “La collection historique d’échantillons de sols de l’essai patrimonial des ‘42 parcelles’ (INRAE, Versailles) : une machine à remonter le temps…” par  van Oort, F.; Paradelo, R.; Monna, F.; Chenu, C.; Baize, D.; Guérin, A.; Breuil, S.; Delarue, G.; Trouvé, A.; Thoisy, J.-C.; Proix, N  vient d’être publié dans Etude et Gestion des Sols. 27, 321-350.

A la suite de travaux précédents sur les états pédogéochimiques (resp. Folkert van Oort – INRAE Versailles), les bilans géochimiques et les impacts de la fertilisation dans les horizons profonds du NEOLUVISOL de lœss du dispositif des 42 parcelles d’INRAE, nous examinons ici des aspects chronologiques d’évolutions intervenues en surface des sols depuis 1928. Pour cela, des séries d’une quinzaine d’échantillons de la collection historique ont été analysées pour une dizaine de traitements représentatifs : engrais à effet acidifiant (sulfate et phosphate d’ammonium), engrais à effet dispersant (nitrate de sodium, sylvinite, chlorure de potassium), superphosphate, amendements à effet alcalinisant (scories de déphosphoration, carbonate de calcium), fumier de cheval, ainsi que deux parcelles témoins’, et parcelles sans apport (i.e. témoins).

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L’article ‘En direct de l’essai patrimonial des 42 parcelles d’INRAE à Versailles – Impacts de fertilisations centenaires en profondeur du Néoluvisol de lœss’ par van Oort et al. vient d’être publié dans Etude et Gestion des Sols

Plan d’expérience de l’essai des 42 parcelles

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L’article “En direct de l’essai patrimonial des 42 parcelles d’INRAE à Versailles – Impacts de fertilisations centenaires en profondeur du Néoluvisol de lœss” par  van Oort, F.; Paradelo, R.; Proix, N.; Baize, D.; Breuil, S.; Foy, E.; Guérin, A.; Monna, F.  vient d’être publié dans Etude et Gestion des Sols. 27, 163 – 187.

Après l’étude d’évolutions pédologiques et géochimiques dans l’horizon de surface (Resp. F. van Oort), ce nouveau volet du projet de valorisation du dispositif des 42 parcelles de l’Inra de Versailles présente les effets d’apports continus de matières fertilisantes à l’échelle du solum, pour une dizaine de traitements : ammoniacaux, engrais-Na et/ou K, phosphatés, CaCO3, fumier et témoins. Pour chaque traitement, les profils de teneur en éléments (0-120 cm) ont été comparés avec le bilan 1929-2014 en surface (0-25 cm), afin de raisonner la pertinence d’études des impacts d’activités anthropiques, restreintes à l’horizon de surface.

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L’article ‘Images of camels on a mammoth tusk from West Siberia’ par Esin et al. publié dans Archaeological Research in Asia

La défense de Mammouth gravée, modélisée par photogrammétrie.

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L’article “Images of camels on a mammoth tusk from West Siberia” par  Esin, Y.; Magail, J.; Monna, F.; Ozheredov, Y.I.  vient d’être publié dans Archaeological Research in Asia. 22, 100180, 1-13.

Ce travail, initié par Yury Esin (Institut d’archéologie et d’histoire, Abakan, Russie), dont les résultats préliminaires ont été publiés dans Journal of Historical, Philological and Cultural Studies, concerne une défense de Mammouth exceptionnelle, découverte en 1988 sur les berges de la rivière Tom (Sibérie). Deux chameaux et probablement une figure anthropomorphe sont gravés à la surface de cette défense, datée aux alentours de 13000 cal. BP. La technique utilisée est typique du paléolithique supérieur tardif de Sibérie de l’Ouest. Il s’agirait des plus anciennes représentations de chameaux en Asie.

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L’article “A laboratory dust generator applying vibration to soil sample: mineralogical study and compositional analyses” par Qu, Z. publié dans Journal of Geophysical Research: Atmospheres

Le générateur d’aérosols installé à l’IPGP par Rémi Losno. Photo R. Losno

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L’article ‘A laboratory dust generator applying vibration to soil sample: mineralogical study and compositional analyses‘ par Qu, Z.; Trabelsi, A.; Losno, R.; Monna, F.; Nowak, S.; Masmoudi, M.; Quisefit, J.-P. vient d’être publié dans Journal of Geophysical Research: Atmospheres. 125, e2019JD032224, 1-10.

Dans le cadre de son travail de doctorat encadré par Rémi Losno, Zihan Qu a développé un générateur d’aérosols capable de reproduire les phénomènes d’aérosolisation que subissent les sols sous l’effet du vent. Quatre sols collectés en Tunisie sont utilisés pour évaluer les capacités de ce nouvel appareil. Les résultats, traités par analyse compositionnelle (CoDA), sont comparés à ceux issus de techniques plus classiques: wind tunnel, fractionnement par tamisage, mais aussi aux compositions chimiques des sols bruts. L’appareil apparaît tout à fait performant face aux outils généralement utilisés pour ce type d’extraction. Son coût est faible et il ne requiert qu’une faible quantité de matériel. En outre, les aérosols générés avec ce système sont comparables à ceux collectés sur le terrain.

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L’article ‘Zn/Pb concentration ratios emphasize spatiotemporal airborne metal dynamics in soils under different land use’ publié dans Water Air & Soil Pollution

Modèle théorique de dispersion des polluants depuis l’usine

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L’article ‘Zn/Pb concentration ratios emphasize spatiotemporal airborne metal dynamics in soils under different land use‘ par Van Oort, F. ; Monna, F. ; Garnier, S. vient d’être publié dans Water Air Soil Pollution. (2020)  231:109.

Il s’agit du dernier article traitant de la contamination métallique des sols autour de la fonderie, aujourd’hui fermée, de Mortagne du Nord. Ce projet a été initié par Folkert van Oort (INRAE, Versailles) il y a 20 ans. Près de 200 échantillons de sols, prélevés dans l’horizon de surface (0-30 cm), ont été analysés pour leurs teneurs en Pb et en Zn. Les dépôts atmosphériques en polluants émis depuis l’usine ont alors été modélisés en fonction de la distance à la source, mais aussi en fonction de l’utilisation des sols. Il s’avère que les rapports Zn/Pb sont très contrastés dans les sols arables, humides et forestiers, indépendamment de la distance à la source, tandis que les concentrations totales de Zn et de Pb, prises séparément, ne sont que peu discriminantes. Les rapports Zn/Pb  représentent un puissant indicateur sur la dynamique d’entrée / sortie des polluants métalliques mobiles et moins mobiles.

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L’article ‘Camel images of the Paleolithic Age on the Tom river in West Siberia’ publié dans Journal of Historical, Philological and Cultural Studies

La défense de Mammouth gravée, modélisée par photogrammétrie.

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L’article “Camel images of the Paleolithic Age on the Tom river in West Siberia” par  Esin, Y.; Magail, J.; Monna, F.; Ozheredov, Y.I.  vient d’être publié dans Journal of Historical, Philological and Cultural Studies, 2019, 2 , 41–68 (en russe).

Ce travail, initié par Yury Esin (Institut d’archéologie et d’histoire, Abakan, Russie) concerne une défense de Mammouth exceptionnelle, découverte en 1988 sur les berges de la rivière Tom (Sibérie). Deux chameaux et probablement une figure anthropomorphe sont gravés à la surface de cette défense, datée aux alentours de 13000 cal. BP. La technique utilisée est typique du paléolithique supérieur tardif de Sibérie de l’Ouest. Il s’agirait des plus anciennes représentations de chameaux en Asie. Read more »

L’article “Contextualization of archaeological information using augmented photospheres, viewed with head-mounted displays” publié dans Sustainability

Projection de la documentation archéologique dans la photosphère

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L’article “Contextualization of archaeological information using augmented photospheres, viewed with head-mounted displays” par Monna, F.; Navarro, N.; Magail, J.; Guillon, R.; Rolland, T.; Wilczek, J.; Esin, Y.; Chateau, C.  vient d’être publié dans Sustainability. 2019 11, 3894, 1-13.

Les photosphères, ou photos 360°, offrent des possibilités remarquables pour percevoir l’espace, en particulier lorsqu’elles sont vues à travers des casques de réalité virtuelle. Ici, nous proposons de profiter de ce potentiel pour l’archéologie et le patrimoine culturel, en augmentant les photosphères avec la documentation existante (cartes 2D ou modèles 3D). Un lot de scripts pour R et Python est fourni afin de rendre possible et simple l’augmentation de ses propres photosphères. Un prototype d’application pour téléphones Android et casques Daydream, réalisé sur Unity 3D, est également disponible ici.

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Prototype d’une visite virtuelle 360° – Les gravures rupestres du Sud Maroc

Le Virtual Tour!

photosphereLe lien vers la visite: ici!

 

La société eScientielle, en collaboration avec l’Université de Bourgogne, a mis en forme plusieurs photosphères 360° capturées lors d’une mission dans le sud marocain en 2019. La mission de terrain, impliquant Tanguy Rolland (doctorant au laboratoire ARTEHIS), Lhoussaine Bouchaou, El Hassan Beeraouz (Université d’Agadir) et moi-même, s’est concentrée sur l’art rupestre présent près de la frontière algérienne. Cet héritage culturel est aujourd’hui menacé par les changements climatiques et le pillage. Le prototype de visite virtuelle présenté ici a pour ambition de démontrer les capacités de la technologie VR en termes de médiation.

L’article “Computer-assisted orientation and drawing of archaeological pottery” publié dans Journal of Computing and cultural heritage.

Le logiciel DACCOR

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L’article “Computer-assisted orientation and drawing of archaeological pottery” par Wilczek, J. ; Monna, F. ; Jébrane, A.; Labruère-Chazal, C.; Navarro, N.; Couette, S. & Chateau Smith, C. vient d’être publié dans Journal of Computing and cultural heritage 2018, 11, 2.

Josef Wilczek a mis au point durant son travail de doctorat un logiciel permettant de déterminer la position de l’axe de rotation d’un fragment de poterie, puis de le dessiner automatiquement suivant les meilleurs standards, actuellement utilisés par la documentation archéologique. Le procédé nécessite une  acquisition 3D de l’objet. Plusieurs procédures d’optimisation sont mises en jeu. Le rendu utilise des techniques développées récemment par l’industrie du jeu vidéo. Le code, développé sous R, est librement accessible.

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L’article “Le programme « Identification et impact des sites miniers abandonnés sur les écosystèmes aquatiques et terrestres actuels » : Bilan au sein du Parc naturel régional du Morvan” par Camizuli et al. publié dans Bourgogne Nature

Prélèvement de sols par Estelle Camizuli dans la forêt du Morvan

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L’article “Le programme « Identification et impact des sites miniers abandonnés sur les écosystèmes aquatiques et terrestres actuels » : Bilan au sein du Parc naturel régional du Morvan” par Estelle Camizuli, Fabrice Monna, Paul Alibert, Pauline Beis, Alain Bermond, Benjamin Bohard, Guillaume Delivet, Claude Gourault, Jean-Paul Guillaumet, Gilles Hamm, Jérôme Labanowski, Caroline Lachiche, Rémi Losno, Adeline Pereira, Christophe Petit, Paul Revelli, Renaud Scheifler, Stéphane Garnier & Folkert van Oort. publié dans Bourgogne Nature.

Le Parc naturel régional du Morvan a été le lieu d’activités minières et métallurgiques dès la protohistoire. Il est important de localiser ces dernières, puis de quantifier leur impact sur les écosystèmes actuels. C’était l’objectif du programme « Identification et impact des sites miniers abandonnés sur les écosystèmes aquatiques et terrestres actuels », un projet de recherche mené par l’université de Bourgogne-Franche-Comté (2009-2013) qui combinait archéologie, géochimie, écologie et écotoxicologie. Des cartes de potentiel minier ont d’abord été dressées afin de guider l’archéologue dans ses prospections de terrain. La biodisponibilité des éléments traces métalliques dans les sols a été estimée, de même que leur impact sur la faune et la flore. Les effets délétères sur les organismes sont toujours observés, bien que les travaux ayant entraîné la contamination remontent souvent à plusieurs centaines, voire milliers d’années.

 

Exposition des photos de l’expédition “Guyane” au Jardin Darcy dans le cadre du projet VIVO!

Les photos de Guyane sur les grilles du Jardin Darcy

Voir l’ensemble du reportage sur le site de CNRS Images ici, ou sur le site LeMonde.fr ici.

Après le musée de la résistance en Morvan et la la fête de la science de Franche-Comté, les photos de la mission “Fragmentation et biological invasions” (resp. Stéphane Garnier, email: Stephane.Garnier@u-bourgogne.fr) sont exposées sur les grilles du Jardin Darcy – Dijon dans le cadre du projet VIVO!

Quel est l’impact de la fragmentation de la forêt sur la biodiversité des oiseaux ? Vaut-il mieux avoir des parcelles plus petites mais moins isolées ou bien l’inverse ? Un groupe de chercheurs a travaillé sur quatre sites des Caraïbes et de Guyane pour tenter de répondre à ces questions (les reportages sont disponibles à la photothèque de CNRS Images).

L’article “Documenting carved stones by 3D modelling – Example of Mongolian deer stones” publié dans Journal of Cultural Heritage

Yury Esin (historien de l’art) examine la stèle #35 du site de Tatsyn Ereg, Mongolie

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L’article “Documenting carved stones by 3D modelling – Example of Mongolian deer stones” par Monna, F.; Esin, Y.; Magail, J.; Granjon, L.; Navarro, N.; Wilczek, J.; Saligny, L.; Couette, S.; Dumontet, A.; Chateau, C. vient d’être publié dans Journal of Cultural Heritage. 2018, 34, 116-128.

Dans le cadre de la mission conjointe Mongolie – Monaco (Resp. Jérome Magail) un travail a été entrepris sur l’enregistrement rapide mais fidèle des nombreux symboles gravés sur les stèles funéraires qui parsèment la steppe mongole. L’utilisation de la modélisation 3D par photogrammétrie s’avère tout à fait performante. Le modèle est finalement traité comme un paysage sur lequel pics et vallées sont recherchés. Plusieurs algorithmes issus de la géographie physique et de la géomorphologie sont testés. Le plus performant est sans doute la ‘positive openness‘, suivi quand cela est possible d’une détection des contours dite ‘Canny edge‘. Les résultats obtenus sont comparables aux meilleurs dessins issus de la documentation archéologique.

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L’article “New constraints on elemental and Pb and Nd isotope compositions of South American and Southern African aerosol sources to the South Atlantic Ocean” publié dans Chemie der Erde / Geochemistry

Emission de poussière en Patagonie

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L’article “New constraints on elemental and Pb and Nd isotope compositions of South American and Southern African aerosol sources to the South Atlantic Ocean.” par R. Khondoker, D. Weiss, T. van de Flierdt, M. Rehkämper, K. Kreissig, B.J. Coles, S. Strekopytov, E. Humphreys-Williams, S. Donga, A. Bory, V. Bout-Roumazeilles, P. Smichowski, P. Cid-Agüero, M. Babinski, R. Losno, F. Monna vient d’être publié dans Chemie der Erde / Geochemistry. 2018, 78, 372-384.

L’étude dirigée par Roulin. Khondoker et Dominik Weiss vise à mieux caractériser chimiquement les aérosols anthropiques et naturels émis en Amérique du Sud et en Afrique australe. En effet, il est nécessaire d’aborder cette question de l’origine des aérosols afin de mieux comprendre le rôle des métaux dans les cycles biogéochimiques de la partie australe de l’océan Atlantique. Les échantillons qui intègrent cette nouvelle base de données ont différentes origines: poussières au bord des routes à Buenos Aires, lichens de Johannesburg, sols de Patagonie, cendres volcaniques de la ceinture andine, aérosols de São Paulo…

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L’article ‘Mobility of Ni, Co, and Mn in ultramafic mining soils of New Caledonia, assessed by kinetic EDTA extractions’ publié dans Environmental Monitoring and Assessment

Vue aérienne de la côte Nord de la Grande Terre – Nouvelle Calédonie

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L’article “Mobility of Ni, Co, and Mn in ultramafic mining soils of New Caledonia, assessed by kinetic EDTA extractions.” par Pasquet, C.; Monna, F.; van Oort, F.; Gunkel-Grillon, P.; Laporte-Magoni, C.; Losno, R.; Chateau, C. vient d’être publié dans  Environmental Monitoring and Assessment. 2018, 190, 638.

Camille Pasquet (email:  pasquet.camille@hotmail.fr) a étudié dans le cadre de sa thèse les capacités de mobilisation du nickel du cobalt et du manganèse dans les sols ultramafiques de Nouvelle Calédonie. Deux séries de sols ont été prélevées: des sols nus dans les mines de nickel en exploitation, et des sols forestiers, soit aux abords des mines, soit en zones éloignées des exploitations. Afin d’estimer la mobilité maximale des métaux, des extractions cinétiques à l’EDTA ont été appliquées. Les métaux dans les sols forestiers apparaissent plus facilement extractibles, mais les sols miniers représentent une plus grande menace du fait de leurs fortes teneurs en métaux, et de leur capacité a être remobilisé par le ruissellement ou l’érosion éolienne.

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